Većina aktivnosti Veleposlanstva podijeljena je na pet odjela.

Odjel za konzularne poslove
Odjel za konzularne poslove pruža konzularne usluge izraelskim i stranim državljanima.

Odjel za kulturu
Odjel za kulturu veleposlanstva Države Izrael promiče i podupire izraelsku kulturu.

Odjel za gospodarstvo
Odjel za gospodarstvo pruža savjetodavne usluge izraelskim izvoznicima koji su zainteresirani za hrvatsko tržište te sektoru hrvatskog gospodarstva zainteresiranom za suradnju s i...

Odjel za odnose s javnošću
Odjel za odnose s javnošću informira javnost o aktivnostima Veleposlanstva i Državi Izrael.

Odjel za administraciju
Odjel za administraciju odgovoran je za zapošljavanje, obuku i upravljanje zaposlenicima, kao i za proračunske, financijske, administrativne i logističke aspekte diplomatskog rada...